在清洁车间食品工厂的选址、设计、布局、建设和改造中，食品净化车间施工，应尽量避免污染源、交叉污染、混搭和差错。工厂环境干净整洁，人和物流合理。采取适当的门禁措施，防止未经授权的人员进入。保存施工和竣工数据生产过程中空气污染严重的建筑物，应建在厂区的下风侧，全年风向多。相互影响的生产工艺不宜设置在同一建筑内时，应在各生产区域之间采取有效的隔离措施。发酵产物的生产应设有专门的发酵车间。
净化车间我们还要注意什么？洁净室应设的人的流、物流通道。人员应按规定的净化程序进入，并应严格控制人数。对于物料可在除去浮尘后拆去外包的通过缓冲间或传递柜送入。不同洁净等级的洁净区物品则通过传递窗传送。中间站宜设在中心位置，以便缩短运送距离。洁净区内不设与本岗位无关的管道。充分利用上下或周围的技术夹层，所有公用管道、工艺管道的主干管均在技术夹层安装。穿越地面、隔墙的管道尽可能靠近使用点并敷设套管，套管内的管道不应有焊缝，管道与套管之间应有可叉的密封措施。进入洁净室的管道应为不锈钢材质。
关于实验室无尘车间的分类：层流式——层流式空气气流运动成一均匀之直线形，空气由覆盖率100之过滤器进入室内，并由高架地板或两侧隔墙板回风，此型式适用于无尘室等级需定较高之环境使用，食品净化车间装修，一般其无尘室等级为Class 1~100。其型式可分为二种：水平层流式：水平式空气自过滤器单方向吹出，由对边墙壁之回风系统回风的，尘埃随风向排出室外，食品净化车间，一般在下流侧污染较严重。优点：构造简单，食品净化车间工程，运转后短时间内即可变成稳定。垂直层流式：房间天花板完全以ULPA过滤器覆盖，空气由上往下吹，可得较高之洁净度，在制程中或工作人员所产生的尘埃可快速排出室外而不会影响其它工作区域。优点：管理容易，运转开始短时间内即可达稳定状态，不易为作业状态或作业人员所影响。复合式——复合式为将乱流式及层流式予以复合或并用，可提供局部超洁净之空气。
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