与传统TEM相比，Cryo-TEM无需进行固定、脱水、染色等处理，外泌体检测服务，样品直接在冷冻状态下进行观察，能够地保留外泌体的天然形态和结构，反映外泌体在体内的真实状态。此外，Cryo-TEM还可以结合电子断层扫描技术，实现外泌体三维结构的重构，进一步深入了解外泌体的空间形态和内部成分分布，为外泌体的结构与功能研究提供更强大的技术支撑——冷冻电子断层扫描（Cryo-ET）结合了冷冻固定技术和电子断层扫描技术，能够在接近天然状态下重构外泌体的3D结构，分辨率可达1~2 nm，是研究外泌体空间结构的重要工具。
冷冻透射电镜（cryo-TEM）无需化学固定与染色，将样品快速浸入液态玻璃化冷冻，在液氮温度下成像；能保留外泌体天然结构（膜、内部成分），适合高分辨率三维重构（冷冻电子断层扫描 cryo-ET）；缺点是设备昂贵、样品制备门槛高。
超薄切片 TEM外泌体经 / 双固定、脱水、树脂包埋后，切成 40–90 nm 超薄切片，染色后观察；适合观察细胞内多囊体释放外泌体的原位结构，或外泌体群体的内部细节。
扫描电镜（SEM）电子束扫描样品表面成像，主要看外泌体在基底上的分布与表面形貌；需喷金导电处理，分辨率略低于 TEM，不适合观察内部膜结构。
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