1. 单细胞全长转录组测序，是指使用ONT测序技术直接读取10X Genomics处理单细胞后，反转录的全长cDNA，通过分析对每个细胞的lsoform进行鉴定和定量，二代高通量测序，并检测单细胞水平的可变剪切事件。单细胞全长转录组测序通过结合单细胞的优势以及三代长读长技术，将单细胞转录组分析从基因水平提升至Isoform水平。
1. 空间转录组，Stereo-Seq是基干DNA纳米球(DNA Nano Ba，DNB)开发的，拥有高通量，超高分辨率，大视场的原位全景式转录组技术，可以实现样本细胞级别的高分辨率空间转录组分析。通过空间芯片捕获组织中的mRNA，并通过时空条形码(CoordinatelD，CID)还原回空间位置，实现组织原位测序，为深入地了解细胞的基因表达及形态与局部环境之间的关系建立强大的研究基础。主要应用于发育研究、研究、演化研究、疾病研究。
1. SMAC-seq，SMAC-seq（single-molecule long-read accessible chromatin mapping
sequencing）：单分子长片段染色质可及性测序，通过长读长纳米孔测序结合转移酶标记开放染色质，在单分子水平直接读取外源修饰标记的可及性信号。
1. pore-c三维组学，Pore-C是结合染色质构象捕获(3C)和三代ONT长读长测序，检测物种基因组多位点交互作用及关联化修饰的一种新技术。流程更简单，无需生物素标记，无需PCR扩增，可检测复杂的GC富集区域及重复基因组区域，同时保留表观修饰信息，二代高通量测序检测，为深入分析三维基因组空间结构特征及染色质多重互作等研究提供条件。
传统T2T组合策略(PacBio HiFi+ONT超长)
过去，二代高通量测序服务，高质量T2T基因组组装多依赖于PacBio HiFi与ONT超长数据的结合。两者优势互补，既保证了组装准确性又跨越了复杂重复区域。然而，该方案需要多平台测序，流程较复杂目所需样本量较高，已逐渐被更的策略取代。
ONT
Only-T2T策略
得益于ONT测序技术的持续进步，二代高通量测序技术，ONT测序数据在准确率方面实现了显著提升，现已能够单独完成端粒到端粒的完整基因组组装。这一方案简化了实验流程、降低了测序成本，并在解析高复杂度基因组时表现出的连续性和完整性，正成为T2T基因组组装的主流趋势。
推荐方案：ONT only T2T
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