残留物通常也会凝固并沉淀在燃油系统的各个部分，包括管道、沉淀柜和日用柜。船舶进入船坞进行燃油舱清洗所需要的时间因船而异，但一般来说每个燃油舱清洗的平均耗时为2-4天，再加之对船舶燃油系统管路的冲洗。如果船舶在船坞中仅仅清洗了燃油舱，宿州邮轮清洗，而没有进行管路冲洗，船舶在接收完合规燃油后仍需要2-5天的时间来冲洗燃油系统管路以达到排放要求。
船东需要考虑使用其他的替代方法进行燃油舱和管路的清洗。目前除了进船坞清洗外，还有在营运期间清洗及使用添加剂进行清洗两种办法。油舱在清洗之前需要排空，这段时间也应计算在内，邮轮清洗底部，且冲洗船上燃油系统管路还需要1-2天。油舱清洗后的残余物应通过正确方式排放或由港口接收设施处理。目前大多数船舶使用的仍是高粘度高硫燃料油(HSFO)，钻石邮轮清洗，此类燃料油会粘附在油舱内壁上，清洗邮轮甲板，非常难清洁。
定期清洗船舶燃油舱安全有效的方法是安排船舶进坞检查和清洗，短期内安排所有正在使用HSFO的船舶进船坞清洗燃油舱并不现实。指南中重要的一个技术环节就是关于船舶在开始使用含硫量低于0.50%m/m的合规燃油前的燃油舱清洗问题。如果船舶在营运过程中安排人工清洗油舱，船长应首先考虑到人员进入密闭舱室的安全问题。
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