农杆菌侵染条件优化菌液OD值、侵染时间、共培养温度直接决定转化效率。菌液浓度过高、侵染过久会导致愈伤菌害褐化；浓度过低则侵染不完全、阳性率极低。标准体系下OD600取值0.6–0.8，侵染10–20分钟，25℃避光共培养为优条件。
组培体系细节调控愈伤诱导阶段依靠2，4-D维持胚性状态；分化阶段调整细胞分裂素与生长素配比，促进芽苗分化；筛选剂浓度需提前预实验确定，浓度过高阳性愈伤，过低会出现假阳性植株；同时需严格控制无菌环境，杂菌与真菌污染。
分化成苗状态优良的阳性愈伤转入分化培养基，光照培养。7–10天陆续出现绿色芽点，2–3周分化出完整小苗。同一愈伤丛生苗过多时，需适当疏苗，避免养分不足导致弱苗、死苗。第六步：生根与炼苗移栽幼苗长至3–5 cm、具有2片真叶时，单株切下转入生根培养基。待根系浓密、植株健壮后，开盖室内炼苗3–5天，拟南芥转化，清洗根部残留琼脂，移栽至营养土，温室常规管理。四、粳稻与籼稻组培差异及优化方案1. 粳稻（常规模式材料）愈伤诱导率高、胚性好、褐化率低、分化再生稳定，采用标准体系即可获得高转化效率，组培难度低、重复性好。
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