






1. 全长lncRNA测序,全长IncRNA测序是指无需对去除rRNA后的RNA进行打断,直接获取逆转录cDNA的5’端到3’端全长序列。不依赖于Poly(A)尾富集,同时对含有Poly(A)尾和不含有Poly(A)尾的IncRNA转录本进行鉴定和定量,并系统的进行可变剪切分析。应用于发育生物学、学研究、免疫、环境毒理研究等。
2. TAIL Iso-seq,基于三代ONT测序的TAIL Iso-seq可以准确量化转录本的Poly(A)尾长度,三代ONT测序,同时分析可变剪接、融合基因、鉴定新异构体,定量转录本表达水平,三代ont测序,深度解析Poly(A)尾在基因表达调控中的作用。主要应用于功能基因组、生长发育、作物防御、作物遗传改良、林木遗传育种、环境适应、免疫反应、动物育种、疾病/发展。
Q1:动植物泛基因组通常采用哪些组装策略?
目前主流策略包括基于参考基因组的泛基因组构建(reference-based
pangenome)与完全无需参考的de novo构建(reference-free
pangenome)。随着长读长测序(如PacBio HiFi与ONT)的发展,de novo组装成为趋势,能更好地保留结构变异与复杂区域的真实信息。
Q2:泛基因组研究中如何表示和比较不同个体的基因组?
通常通过“图泛基因组”(graph-based
pangenome)形式,将多个个体的序列以图结构呈现,节点代表保守区域,分支代表变异位点。这种表示方式能更直观地展示基因变异和结构差异,三代ont测序服务,且便于后续变异检测与注释。

1. DNA化(WGBS),全基因组化测序(Whole Genome Bisulfite Sequencing,WGBS,也叫BS-seq)是通过重亚硫酸盐处理将基因组中未发生化的C碱基进行转换用以区分具有化修饰的C碱基,并结合高通量测序技术判断CpG/CHG/CHH位点是否发生化的一种方法。
2. ONT DNA化,DNA化在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类发生中起着重要作用,是目前新的研究热点之一。ONT测序无需经过重硫酸盐转化或者免疫沉淀富集实验,直接测序同时可检测5mC、5hmC、6mA、4mC等修饰。
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