比较基因组与进化分析
挑选了20株子囊菌和4株担子菌，与该研究的3株病原菌共同构建系统发育树。结果表明，Hypomyces 和Escovopsis属在1751万年前分化，Hypomyces和Cladobotryum属在1712万年前分化。说明蛛网病病原菌在基因上是相似的，在遗传水平上存在相同的机制。
共线性分析表明，这三个菌株具有高度的共线性保守性，菌株CB-Mi和CB-Ab之间的基因组重排事件较少，在染色体水平上存在保守contigs和可变contigs，可变contigs发生了更多的重排事件。
细菌DRS
细菌直接RNA测序（DRS）：基于Nanopore测序平台，能够直接读取完整的天然RNA分子，无需进行逆转录或PCR扩增，可同步完成多种RNA类型的检测，二代基因测序，并直接鉴定单碱基水平的：m6A、m5C、假尿苷、肌苷和2-O-化等多种RNA修饰位点，同时解析转录本及操纵子结构。
细菌DRS技术的实验原理
对提取的细菌总RNA进行rRNA去除后，对剩余RNA进行直接RNA建库测序，在获得转录本和操纵子结构的同时，获取RNA分子上的多种修饰信息。
1. 多组学研究，由于可变剪切（人类90%的基因表达的RNA存在可变剪切）的存在，一个基因往往对应多个转录本（lsoform），因此对转录本的定量非常有必要。传统的转录组只能对基因进行表达定量〈基于转录本进行GO、KEGG等分析），lsoform定量全长转录组可以实现转录本的定量，对基因的每一个Isoform进行功能注释，基于lsoform定量全长转录组的多组学关联分析还原真实的系统生物学过程。
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