农杆菌侵染与共培养将活化的农杆菌菌液调配至适宜OD值，将筛选后的胚性愈伤浸入菌液浸泡侵染，适度震荡保证菌液充分附着；捞出愈伤吸干表面多余菌液，接种于共培养基，25℃避光暗培养2–3天，完成T-DNA的转移与基因组整合。4. 抗性筛选与愈伤继代共培养结束后，烟草转化，用无菌水洗脱愈伤表面残留农杆菌，吸干水分后转入含对应筛选剂的筛选培养基，28℃避光培养。经过2–3轮继代筛选，淘汰未转化的阴性愈伤，获得增殖状态良好的抗性阳性愈伤组织。
主流玉米基因转化方法目前玉米商业化转化与科研转化以农杆菌介导法和基因轰击法（微粒轰击法）为两大方法，同时新型转化技术持续优化迭代，各方法适配不同实验场景与育种需求。
农杆菌介导转化法（主流）该方法基于根癌农杆菌的天然侵染特性改造而来，是目前玉米转化效率、遗传稳定性、商业化应用广的技术，优势是外源基因拷贝数低、整合位点稳定、遗传干扰小。
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