1. 单倍型T2T基因组组装，主要针对高杂合二倍体及多倍体植物开发新的解决方案，主要采用二代高通量和三代ONT结合单独开发的生信系统进行组装。主要应用于指导下游分子育种、subgenome比较分析、多倍体起源与进化。
2. 泛基因组研究，利用二代高通量、三代ONT测序和生物信息学分析，对不同但又相互关联的个体材料进行较高深度测序和组装，构建泛基因组图谱，该物种完整的遗传信息。为研究物种遗传多样性、作物改良、物种进化及生态适应提供研究基础。
PtoGntK与PtoRAP2.12 调控植物生长
QTL作图和GWAS分析发现PtoGntK与植物生长显著相关，其启动子区域SNPs位于可及区域。PtoGntK的过表达促进生长，而敲除导致生长迟缓。酵母单杂交等实验证实 PtORAP2.12结合PtoGntK启动子的去化可及性区域，其表达，刺激植物生长。
结论
本研究揭示DNA化通过调控染色质可及性影响基因表达的机制，全基因组重测序，即DNA去化改变染色质可及性，影响转录因子PtoRAP2.12与PtoGntK启动子结合来调控转录、影响植物生长，为理解木本植物表观遗传调控机制及分子设计改良提供理论基础。
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